故事发生在《德国八三年》的三年后。

影片根据同名游戏改编，“代号47”（鲁伯特·弗兰德RupertFriend饰）是神秘杀手组织的头号杀手，他性格冷静，智慧过人，行动神秘低调，从来没人知道他的底细，只靠颈后位置的一个纹身条码辨认身份。“代号47”既是罪恶的化身，又是善意的使徒。他从不过问犯罪的真理及意义，直到碰上一名惊为天人神祕女子卡